کتاب پرونده فوق سری ۲۰۴۰ در قالب رمان از فعالیتهای رژیم صهیونیستی علیه بشریت به خصوص ایران، مانند ترور دانشمندان هستهای تا نبردهای بیوتروریسم و ربودن چهرههای شاخص انقلاب نوشته است. محمد قنبری برای نوشتن کتاب پرونده فوق سری ۲۰۴۰ از شخصیتهای حقیقی و اسناد تاریخی استفاده کرده است.